Réaliser des études de neuroimagerie implique souvent plusieurs étapes nécessitant différents outils. Ces outils peuvent être difficiles à utiliser pour un non-expert tel qu’un chercheur spécialisé en deep learning et rendre compliqué l’exploitation des données de neuroimagerie pour une étude. Clinica (www.clinica.run) est une plateforme logicielle qui a pour but de faciliter la réalisation d’études en neuroimagerie en proposant des outils de management des données et des pipelines de pre-processing. Clinica repose sur trois axes principaux : - Les convertisseurs BIDS (Brain Imaging Data Structure, https://bids.neuroimaging.io), qui permettent de convertir différentes bases de données de leur format brut à une structure claire et rigoureuse établie par la communauté, - Les pre-processings disponibles à travers différents pipelines pour traiter des images (T1w MRI, FLAIR, DWI, TEP), - Les pipelines de statistique et de machine learning. Du point de vue d’une étude de deep learning en neuroimagerie, Clinica fournit plusieurs avantage distincts : - Un management des données simplifié par des entrées et sorties suivants la norme communautaire BIDS pour les entrées et CAPS pour les sorties, complété par des outils de manipulation des BIDS et CAPS, - Un accès à moindre effort à des pipelines de pre-processing fréquemment utilisés en deep learning, - Une traçabilité et reproductibilité accrue du traitement des données (images et métadonnées). Clinica permet ainsi aux chercheurs en deep learning de se focaliser sur la partie apprentissage, et nous pensons qu’il permet donc de réaliser des études de deep learning en neuroimagerie de meilleures qualités et d’une meilleure reproductibilité.