E-Biothon: an experimental platform for BioInformatics - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique
Communication Dans Un Congrès Année : 2015

E-Biothon: an experimental platform for BioInformatics

Michel Daydé
Algorithmes Parallèles et Optimisation
Institut National Polytechnique (Toulouse)
Benjamin Depardon
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 934276
SysFera [Villeurbanne]
Alain Franc
from patterns to models in computational biodiversity and biotechnology
Biodiversité, Gènes & Communautés
Jean-François Gibrat
Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
Romaric Guillier
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 836810
Laboratoire de l'Informatique du Parallélisme
Algorithms and Software Architectures for Distributed and HPC Platforms
Yasaman Karami
Biologie Computationnelle et Quantitative = Laboratory of Computational and Quantitative Biology
Christian Pérez
Algorithms and Software Architectures for Distributed and HPC Platforms
CV
Frédéric Suter
Algorithms and Software Architectures for Distributed and HPC Platforms
Centre de Calcul de l'IN2P3
Marie Chabbert
Biologie Neurovasculaire et Mitochondriale Intégrée
Faculté de Médecine d'Angers
Bruck Taddese
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 970883
Biologie Neurovasculaire et Mitochondriale Intégrée
Faculté de Médecine d'Angers
Sylvie Thérond
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 950935
Institut du développement et des ressources en informatique scientifique

Résumé

The E-Biothon platform is an experimental Cloud platform to help speed up and advance research in biology, health and environment. It is based on a Blue Gene/P system and a web portal that allow members of the bioinformatics community to easily launch their scientific applications. We describe in this paper the technical capacities of the platform, the different applications supported and finally a set of user experiences on the platform.

Domaines

Calcul parallèle, distribué et partagé [cs.DC] Bio-informatique [q-bio.QM]
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Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Romaric Guillier  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://inria.hal.science/hal-01207320

Soumis le : mercredi 30 septembre 2015-15:14:25

Dernière modification le : mercredi 13 novembre 2024-11:08:03

Archivage à long terme le : jeudi 31 décembre 2015-10:35:00

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Dates et versions

hal-01207320 , version 1 (30-09-2015)

Identifiants

Citer

Michel Daydé, Benjamin Depardon, Alain Franc, Jean-François Gibrat, Romaric Guillier, et al.. E-Biothon: an experimental platform for BioInformatics. International Conference on Computer Science and Information Technologies, Sep 2015, Yerevan, Armenia. ⟨10.1109/CSITechnol.2015.7358239⟩. ⟨hal-01207320⟩

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