Tests multiples pour la comparaison des probabilités de survenue d'une infidélité de transcription dans des ARNm sains et cancéreux - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique
Communication Dans Un Congrès Année : 2010

Tests multiples pour la comparaison des probabilités de survenue d'une infidélité de transcription dans des ARNm sains et cancéreux

Marie Brulliard
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  • IdRef : 136765440
Benoit Thouvenot
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Sandrine Jacquenet
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Virginie Ogier
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Olivier Roitel
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Résumé

L'implication d'erreurs de transcription dans l'hétérogénéité du cancer avait jusqu'alors été peu considérée. En effet, la transcription est supposée fidèle et contrôlée par un système complexe de vérification. Afin d'étudier l'hétérogénéité des séquences d'ARNm issus de tissus sains et cancéreux de 17 gènes d'intérêt, les probabilités de survenue d'une substitution de base ont été comparées à chaque position des séquences des transcrits à l'aide d'une procédure de tests multiples. Pour cela, les séquences Expressed Sequences Tags, qui sont des copies partielles des ARNm d'un gène, ont été utilisées et un modèle prenant en compte l'erreur de séquençage inhérente à ces données a été proposé. Enfin, l'estimateur Location Based Estimator du nombre moyen de tests faux positifs a été étendu au cas de statistiques de tests discrètes. Cette étude préliminaire a ainsi permis de mettre en évidence les positions des ARNm plus fréquemment sujettes à des substitutions dans les tissus cancéreux que dans les tissus sains et d'introduire la notion d'infidélité de transcription chez l'Homme.
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inria-00494733 , version 1 (24-06-2010)

Identifiants

  • HAL Id : inria-00494733 , version 1

Citer

Olivier Collignon, Marie Brulliard, Jean-Marie Monnez, Pierre Vallois, Benoit Thouvenot, et al.. Tests multiples pour la comparaison des probabilités de survenue d'une infidélité de transcription dans des ARNm sains et cancéreux. 42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France. ⟨inria-00494733⟩
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