Dans cet article nous présentons une technique de segmentation de maillages guidée par des connaissances a priori. Ces connaissances sont organisées dans une ontologie. Ce travail est fait dans un contexte anatomique, le but de la segmentation est d'identifier les différentes parties d'un organe anatomique grâce à leur forme géométrique. L'ontologie fournit les paramètres nécessaires pour segmenter le maillage de départ correspondant à un organe. La segmentation est répétée suivant la hiérarchie de l'ontologie pour étiqueter les différentes parties et sous-parties de l'organe de départ.