Contribution au développement d'une méthode hybride discriminante-générative de prédiction de la structure secondaire des protéines - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique Access content directly
Reports Year : 2007

Contribution au développement d'une méthode hybride discriminante-générative de prédiction de la structure secondaire des protéines

Julien Vannesson
  • Function : Author
  • PersonId : 843940

Abstract

De nombreuses méthodes ont été développées ces dernières décennies pour effectuer la prédiction de la structure secondaire des protéines. Alors que les systèmes à base de réseaux de neurones se sont imposés en premier, d'autres méthodes ont vu le jour avec des résultats tout à fait prometteurs et parmi elles notamment, les SVM multiclasses. Ainsi, ce document traite dans un premier temps de ce qu'est une M-SVM et comment l'appliquer au problème du traitement des séquences protéiques. Ensuite, nous voyons quelle est l'architecture proposée par l'équipe et la mise en oeuvre du premier module concernant l'utilisation des alignements, avec les problèmes de pondération associés. Enfin les tests de cette nouvelle architecture avec les alignements montrent que le gain de précision est de plus de 5% en dépassant les 69% de taux de reconnaissance.
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Dates and versions

inria-00184160 , version 1 (30-10-2007)

Identifiers

  • HAL Id : inria-00184160 , version 1

Cite

Julien Vannesson. Contribution au développement d'une méthode hybride discriminante-générative de prédiction de la structure secondaire des protéines. [Travaux universitaires] 2007. ⟨inria-00184160⟩
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