Restauration d'images biologiques 3D en microscopie confocale par Transformée en Ondelettes Complexes - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique Access content directly
Reports (Research Report) Year : 2006

Restauration d'images biologiques 3D en microscopie confocale par Transformée en Ondelettes Complexes

Abstract

La microscopie confocale est une méthode puissante pour l'imagerie 3D de spécimens biologiques. Néanmoins, les images acquises sont dégradées non seulement par du flou dû à la lumière provenant de zones non focalisées du spécimen, mais aussi par un bruit de Poisson dû à la détection. Plusieurs algorithmes de déconvolution ont été proposés pour réduire ces dégradations. Un des plus utilisés est l'algorithme itératif de Richardson-Lucy, qui calcule un maximum de vraisemblance adapté à une statistique poissonienne. Mais cet algorithme tend à amplifier le bruit. Une solution consiste alors à introduire une contrainte de régularisation (par exemple, fondée sur la Variation Totale). Ici, nous nous concentrons sur des méthodes fondées sur l'analyse par ondelettes, en particulier sur des méthodes de débruitage via la transformée en ondelettes, qui semblent être plus appropriées à la microscopie en fluorescence 3D. Nous développons dans ce rapport un algorithme de Transformation en Ondelettes Complexes 3D introduit par N. Kingsbury. Celui-ci permet une décomposition invariante par translation et rotation et une sélectivité directionnelle des coefficients en ondelettes. Nous montrons sur des images synthétiques et sur des images réelles les résultats de cet algorithme de débruitage. Ce dernier est ensuite inséré dans le processus de déconvolution.
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Dates and versions

inria-00070500 , version 1 (19-05-2006)

Identifiers

  • HAL Id : inria-00070500 , version 1

Cite

Gemma Pons Bernad, Laure Blanc-Féraud, Josiane Zerubia. Restauration d'images biologiques 3D en microscopie confocale par Transformée en Ondelettes Complexes. [Rapport de recherche] RR-5507, INRIA. 2006, pp.72. ⟨inria-00070500⟩
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