Voisinage d'arbre évolutif appliqué au problème Maximum Parcimonie
Abstract
Le problème Maximum Parcimonie vise à reconstruire un arbre phylogénétique à partir de séquences ADN de manières à ce que le nombre de mutations génétiques survenues au cours de l'évolution soit minimal. Pour résoudre ce problème NP-complet, de nombreuses méthodes heuristiques ont été développées, pour la plupart basées sur la recherche locale. Ici, nous nous intéressons à l'influence de la relation de voisinage utilisée et introduisons le concept de voisinage évolutif. Nous montrons empiriquement que ce voisinage évolutif s'avère plus puissant et robuste que les voisinages classiques.