Dans le cadre du projet Deep Impact qui cherche à étudier le rendement des cultures de blé et de colza en fonction de la biodiversité du sol mais aussi des conditions environnementales, de nombreuses données vont être générées. Ce stage vise à trouver une manière pratique et efficace pour interroger ce genre de données, afin de simplifier le travail des biologistes. Nous nous sommes appuyés sur les résultats et les données d’un article traitant de la diversité microbienne et de la santé des plantes pour réfléchir à un schéma de données idéal. Nous avons aussi récupéré une partie de l’ontologie Ncbi Taxonomy afin de la lier à nos données. Après avoir défini une structure de données et avoir construit le jeu de données correspondant, en transformant les fichiers originaux, en les complétant et parfois même en les créant entièrement, nous avons intégré ces fichiers sur la plateforme AskOmics. C’est sur cette plateforme que nous avons pu interroger les données de façon simple. Les différentes requêtes effectuées ont montré que l’utilisation d’AskOmics était idéale, aussi bien au niveau de la simplicité d’utilisation que de la justesse des résultats obtenus. Nous avons alors créé une librairie de requêtes ainsi que des requêtes modèles, réutilisables facilement. Toutes ces requêtes pourront servir lors d’autres projets comprenant des données agricoles, comme le projet Deep Impact.