Structural conservation of remote homologues: better and further in contact fragments - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique
Communication Dans Un Congrès Année : 2015

Structural conservation of remote homologues: better and further in contact fragments

Résumé

We address here a basic question on sequence-structure relationships in proteins: does a protein sequence depict a structure with a uniform faithfulness all along the sequence ? We investigate this question by defining contact fragments and show that their sequence homologs are significantly more faithful to structure than randomly chosen fragments.

Mots clés

Proteins structure contacts

Domaines

Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]
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https://inria.hal.science/hal-01214506

Soumis le : mardi 13 octobre 2015-17:23:38

Dernière modification le : jeudi 7 novembre 2024-13:34:02

Archivage à long terme le : jeudi 14 janvier 2016-10:40:44

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Dates et versions

hal-01214506 , version 1 (13-10-2015)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01214506 , version 1

Citer

Clovis Galiez, François Coste. Structural conservation of remote homologues: better and further in contact fragments. 3DSIG: Structural Bioinformatics and Computational Biophysics, Jul 2015, Dublin, France. ⟨hal-01214506⟩

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