TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique
Article Dans Une Revue Bioinformation Année : 2014

TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues

Résumé

We describe TmiRUsite and TmiROSite scripts developed using python as tools for the extraction of nucleotide sequences for miRNA binding sites with their encoded amino acid residue sequences. The predicted data find utility in molecular and evolutionary biology studies. They are also used in studying miRNA binding sites in animals and plants.
Nous présentons des scripts en python pour l'extraction de séquences de nucléotides de sites de fixation de miRNAs. Les données prédites sont utiles en phylogénie, pour les animaux et les plantes.

Mots clés

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01071330 , version 1 (03-10-2014)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01071330 , version 1

Citer

Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko. TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues. Bioinformation, 2014, 10 (7), pp.472-473. ⟨hal-01071330⟩
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