Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique Accéder directement au contenu
Rapport (Rapport Technique) Année : 2006

Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade

Christian Baudet
Zanoni Dias
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 936378

Résumé

Neste trabalho realizamos estudos sobre métodos para a identificação de polimorfismos de base única, comumente conhecidos pela sigla SNP (em inglês, Single Nucleotide Polymorphism). Identificar este tipo de polimorfismo é um processo importante pois, devido ao fato de eles poderem influenciar a estabilidade ou, até mesmo, a estrutura das proteínas codificadas pelos genes, os SNPs podem estar relacionados a diversas doenças. Um bom método de identificação deve ser capaz de apontar as posições polimórficas e fornecer uma medida de confiabilidade para a detecção realizada. Neste sentido, estudamos dois métodos: polybayes e MSASNP.O primeiro método trata-se de um programa que realiza análise bayesiana para análise das seqüências e identificação de SNPs. O segundo método adota uma estratégia simples, utilizando conceitos básicos de probabilidade. Os testes mostraram que o polybayes é o mais indicado por ser capaz de indentificar os SNPs e fornecer valores mais confiáveis sobre a probabilidade de detecção correta de um SNP.
Fichier principal
Vignette du fichier
06-15.pdf (195.65 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Loading...

Dates et versions

hal-01092998 , version 1 (09-12-2014)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01092998 , version 1

Citer

Christian Baudet, Miguel Galves, Zanoni Dias. Comparação de métodos para determinação de SNPs com medidas de confiabilidade. [Technical Report] 06-15, Instituto de Computação - UNICAMP. 2006. ⟨hal-01092998⟩

Collections

LARA
88 Consultations
75 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More