Treillis de concepts et ontologies pour interroger l'annuaire de sources de données biologiques BioRegistry
Résumé
Les sources de données biologiques disponibles sur le Web aujourd'hui sont multiples et hétérogènes. L'utilisation optimale de ces ressources nécessite de la part des utilisateurs des compétences à la fois en informatique et en biologie, à cause du manque de documentation et des difficultés d'interaction avec les sources de données. De fait, les contenus de ces sources de données restent souvent sous-exploités. Nous présentons ici une approche qui s'appuie sur l'analyse de concepts formels, pour organiser et rechercher des sources de données biologiques pertinentes pour satisfaire une requête donnée. Le travail consiste à construire un treillis de concepts à partir des méta-données associées aux sources. Le concept construit à partir d'une requête donnée est alors classifié dans le treillis. La réponse à la requête est ensuite fournie par l'extraction des sources de données appartenant aux extensions des concepts subsumant le concept requête dans le treillis. Les sources ainsi retournées peuvent être triées selon l'ordre de spécificité des concepts dans le treillis. Une procédure de raffinement de requête, s'appuyant sur des ontologies de domaines, permet d'améliorer le rappel par généralisation ou par spécialisation
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