L'importance des variations individuelles dans les réactions aux médicaments devient un problème conséquent à la fois au niveau de la recherche pharmaceutique et au niveau médical. Notre projet de recherche vise à intégrer des données cliniques et génétiques issues d'études cliniques avec comme objectif d'en extraire une connaissance sur les relations existantes entre un génotype particulier et son action sur l'effet d'un médicament. Pour répondre à ce problème, nous cherchons des méthodes de fouille adaptées aux données biomédicales que nous souhaitons manipuler et capables d'intégrer les connaissances du domaine sous forme d'ontologie. Ce projet est l'objet d'une thèse qui a commencé en novembre 2004.