On présente dans cet article une méthode d'extraction d'associations entre événements indé-sirables médicamenteux (EIM) utilisant les structures de patrons. Cette méthode permet une comparaison d'EIM fondée sur des ontologies biomédicales et a déjà été présentée avec une application sur des dossiers médicaux électroniques. Une application sur un autre type de données utilisant d'autres ontologies biomédi-cales est présentée ici, ainsi qu'une comparaison et une évaluation plus détaillée des règles extraites. Cette méthode se révèle flexible puisque pouvant être appliquée à divers jeux de données et ontologies, et capable d'extraire des règles d'associations entre EIM avec une représentation expressive de ces EIM.