Modélisation du métabolisme des monocarbones et du cycle de la méthionine
Abstract
Les anomalies du métabolisme des monocarbones, dépendant des vitamines du groupe B sont à la base de nombreuses maladies : maladies cardiovasculaires, Alzheimer, maladies génétiques... L'analyse des voies métaboliques des monocarbones est donc essentielle à la compréhension des mécanismes cellulaires touchés par ces pathologies. Cependant, dans le cadre de la biologie conventionelle, cette étude reste très contraignante du fait de la difficultés des experiences. Notre approche propose une analyse in silico par modélisation du réseau métabolique des monocarbones pour pallier à ce problème. L'étude s'articule autour de résultats biologiques et méthodologiques. Une nouvelle méthode de modélisation dynamique et topologique, basée sur l'utilisation de différents formalismes (ODE, modélisation canonique, modélisation stoechiométrique) corrobore les conclusions tirées des expériences. Les nouveaux modèles ainsi formulés permettent de proposer des hypothèses amenant à de nouvelles perspectives expérimentales.