Comprehensive human urine standards for comparability and standardization in clinical proteome analysis - Inria - Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue PROTEOMICS - Clinical Applications Année : 2011

Comprehensive human urine standards for comparability and standardization in clinical proteome analysis

Harald Mischak
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Walter Kolch
  • Fonction : Auteur
Michalis Aivaliotis
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David Bouyssié
Magali Court
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Hassan Dihazi
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Gry H Dihazi
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Julia Franke
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Jérôme Garin
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Alexander Iphöfer
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Lothar Jänsch
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Chrystelle Lacroix
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Manousos Makridakis
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Christophe D. Masselon
Jochen Metzger
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Bernard Monsarrat
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Michal Mrug
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Martin Norling
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Jan Novak
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Andreas Pich
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Andrew Pitt
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Erik Bongcam-Rudloff
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Justyna Siwy
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Hitoshi Suzuki
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Visith Thongboonkerd
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Li-Shun Wang
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Jérôme Zoidakis
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Petra Zürbig
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Joost P Schanstra
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Antonia Vlahou
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Résumé

Purpose-Urine proteomics is emerging as a powerful tool for biomarker discovery. The purpose of this study is the development of a well characterized "real life" sample that can be used as reference standard in urine clinical proteomics studies. Experimental design-We report on the generation of male and female urine samples that are extensively characterized by different platforms and methods (CE-MS, LC-MS, LC-MS/MS, GeLC-MS, and 2DE-MS) for their proteome and peptidome. In several cases analysis involved a definition of the actual biochemical entities, i.e. proteins/peptides associated with molecular mass and detected posttranslational modifications and the relative abundance of these compounds. Results-The combination of different technologies allowed coverage of a wide mass range revealing the advantages and complementarities of the different technologies. Application of these samples in "inter-laboratory" and "inter-platform" data comparison is also demonstrated.
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2010, Mischak, Proteomics Clinical Applications.pdf (1.79 Mo) Télécharger le fichier
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Dates et versions

hal-03080260 , version 1 (17-12-2020)

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Citer

Harald Mischak, Walter Kolch, Michalis Aivaliotis, David Bouyssié, Magali Court, et al.. Comprehensive human urine standards for comparability and standardization in clinical proteome analysis. PROTEOMICS - Clinical Applications, 2011, 4 (4), pp.464 - 478. ⟨10.1002/prca.200900189⟩. ⟨hal-03080260⟩
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